中文 网站
Nat med | Ny fomba amam-pahafantarana marobe dia manatontosa ny fametahana ny fivontosana an-tsokosoko, ny fiambenana sy ny mikraoba ny kansera colorectal Colorural dia manambara ny fifandraisan'ny Microbiome miaraka amin'ny rafitra fanefitra
Na dia efa nianatra be ny biomorkers ho an'ny kansera Colla Kilonga, tato anatin'ny taona vitsivitsy, ny torolàlana momba ny klinika ankehitriny dia ny tsy fahatomombanana tsy misy dikany (MMR) (MSI) (ankoatry ny fizahana pathology) Ny mpikaroka dia nanamarika ny tsy fisian'ny fikambanan-tena eo amin'ny valin-kafatra tsy manam-paharoa sy ny zava-mahadomelina, ary ny fivontosana zavamaniry ao amin'ny kansomera kansera (TCGA) Colorectal Correctal Canrectal sy ny fahaveloman'ny homamiadana.
Araka ny nandroso ny fikarohana, ny toetran'ny homamiadana Colorectal Kilonga, anisan'izany ny kansera, ny stromal, na ny mikrôla amin'ny homamiadana, dia mbola misy fiantraikany amin'ny valim-pitsaboana, fa misy ny fahatakarana ny vokatr'izany.
Mba handroahana ny fifandraisan'ny votoatin'ny phenotypika sy ny fiafarana, ny mpikaroka avy amin'ny Institute of Medical of Medical ao Qatar dia namorona sy nanamarina ny antokon-javatra azo antoka tamin'ny fitambaran'ny toetra tsara sy ny tsy fitovian-kevitra momba ny fiarovana ny tsimok'aretina (ICR). Ny ekipa dia nanao famakafakana amim-pahamendrehana momba ny santionany vaovao avy amin'ny olona 348 misy kansera colorectal ao amin'ny Kilonga ary mifehy ny tsaramaso tsara, ary ny ranon-tsofina lalina sy ny bakteria Navoaka tamin'ny fanafody natiora ny fandalinana ho "fivontosam-bokatra sy ny tsy fitoviana ary ny Microbiome Atlas Colam".
Lahatsoratra navoaka tao amin'ny fitsaboana natiora
Famintinana Ac-Icam
Ny mpikaroka dia nampiasa sehatra orthogonal iray hamakafaka ny santionany fromote vaovao ary nifanentana tamin'ny tavy ara-pahasalamana ara-pahasalamana (tsiroaroa-normal-normal) avy amin'ny marary misy kansera momba ny kansera tsy misy dikany raha tsy misy fitsaboana. Miorina amin'ny sequencing exome (WES), ny fanaraha-maso ny angon-drakitra momba ny kalitao, sy ny fanoratana ny fitsipi-pitondran-tena, ny angon-drakitra Genomika avy amin'ny marary 348 dia notazonina ary nampiasaina tamin'ny famakafakana ny median-4 4.6 taona. Ny ekipa mpikaroka dia niantso ity loharano ity Sidra-Lumc Ac-Icam: sarintany sy torolàlana ho an'ny fifaneraserana amin'ny kansera-kansera (Sary 1).
Ny fanasokajiana molekiola amin'ny fampiasana ICR
Misintona ny marika totohondry tsy misy fotony ho an'ny ImmunosurKeillan Kansera mitohy, izay antsoina hoe tsy miovaova (ICR), ny ekipa mpikaroka dia nanery ny hanaratsy ny karazana homamiadana samihafa, anisan'izany ny kansera meloka, ary homamiadan'ny homamiadana, ary homamiadana ny homamiadana, ary homamiadana. ICR koa dia nifandray tamin'ny valinteny momba ny Immunotherapy amin'ny karazana kansera isan-karazany, ao anatin'izany ny homamiadan'ny nono.
Voalohany, ny mpikaroka dia nanamarina ny sonia ICR ny fomba fiasa Ac-ICAM, amin'ny alàlan'ny fanoratana ny co-co-coclinicificification Ny mpikaroka dia nanondro ny fijangajangana mifandraika amin'ny subtypes molekiola marimaritra iraisana (cms), fanasokajiana mifototra amin'ny kansera amin'ny kansera. Ny sokajy CMS dia ahitana CMS1 / Immune, CMS2 / Canonical, CMS3 / metabolic ary cms4 / mesenchymal. Ny famakafakana dia nasehon'ny tsimokaretina ICR tamin'ny làlan'ny sela kansera sasany tao amin'ny sela cms rehetra, ary ny fanitsiana tsara miaraka amin'ny làlam-pifidianana immunosuppressive sy ny làlam-pifidianana dia voamarina ao amin'ny fivontosana CMS4 ihany.
Amin'ny cms rehetra, ny habetsaky ny mpamono olona voajanahary (NK) sy ny sela sela dia avo indrindra amin'ny subtype avo indrindra, miaraka amin'ny subune kokoa amin'ny orona sy pfs hafa.
Sary 1. Famolavolana fandalinana Ac-icam, sonia tsy voafehy, tsy misy fepetra, ny tsy fahampian-tsakafo ary ny subtypal sy ny fiveloman'ny molekiola.
ICR dia misambotra ny sela mandrobona, nohamafisiny
Ny sela vitsy an'isa ao an-tsoratry ny tavy mitete dia voalaza fa voafaritra ho an'ny antigen tumor (latsaky ny 10%). Noho izany, ny ankamaroan'ny sela tsy misy tumor t t dia antsoina hoe sela bisandster T sela (Bystander T Sela). Ny fanitsiana mafy indrindra amin'ny sela TCR tsy miangatra dia voamarina ao amin'ny sela sela sy ny setroka Leukocyte (ho hitan'i rna-seq), izay azo ampiasaina hanombanana ny sela sela (Sary 2a). Ao amin'ny clusters ICR (ankapobeny sy ny CMS), ny famenoana ambony indrindra amin'ny fiarovana ny hery miafina dia voamarina ao amin'ny ICR-High sy CMS Subtype CMS1 / Vondrona CMS (Sary 2C), miaraka amin'ny haingam-pandeha ambony indrindra. Mampiasa ny transcriptome manontolo (18,270 genes enina (Ifng, Stat1, IRF1, CCL5, GZMA, ary CXCT10) dia anisan'ireo fototarazo ambony indrindra tamin'ny TCR Immunoseq TCR dia mifanitsy amin'ny ankamaroan'ny tariby ICR noho ny fanitsiana ny fampiasana ny CD8 + Markers Fandraisana Tumor-resakers (Sary 2F sy 2G). Ho fehiny, ny famakafakana etsy ambony dia nanoro hevitra fa ny sonia ICR dia misintona ny fisian'ny sela masiaka, izay nohamafisin'ny sela sy mety hanazava ny fiantraikan'ny prognostika.
Sary 2. TCR sy ny fifandraisan-davitra miaraka amin'ny fototarano mifandraika, tsy misy hery sy ny subtypes molekiola.
Ny firafitra microbiome amin'ny tavy sy ny kansera homamiadana
Ny mpikaroka dia nanao sela 16s RRNA tamin'ny fampiasana ny ADN nalaina avy amin'ny fivontosana sy ny taolam-paty ara-pahasalamana ara-pahasalamana avy amin'ny marary 246 (Sary 3a). Raha ny fanamarinana dia namakafaka ny angon-drakitra 16s Rrna Gene ny mpikaroka avy amin'ny santionany 42 fanampiny izay tsy nanisy ADD normal normal. Voalohany, ny mpikaroka dia nampitaha ny haben'ny Flora be dia be teo amin'ny fivontosana sy ny tavy colon. Clostridium Perfringens dia nitombo be tao amin'ny tsaramaso raha oharina amin'ireo santionany salama (Sary 3a-3D). Tsy nisy fahasamihafana lehibe tamin'ny fahasamihafana lehibe (fahasamihafana sy be dia be ny santionany iray amin'ny santionany iray) eo anelanelan'ny fivontosana sy ny santionany ara-pahasalamana, ary ny fihenan'ny tsy fitovian-kevitra dia voamarina amin'ny fivontosana avo lenta.
Mba hahitana ny fikambanana mifandraika amin'ny toeram-pitsaboana sy ny valim-pitsaboana, dia ny valin'ny klinika, ny mpikaroka dia mikendry ny hampiasa angon-drakitra 16s RRNA GEQUENCing hamantarana ny endri-javatra microbiome izay manambara ny fahaveloman'ny Microbiome. Tao amin'ny AC-ICAMAM246, ny mpikaroka dia nihazakazaka modely fanodinana OS Cox izay nifidy ny endri-javatra 41 miaraka amin'ny kafe tsy misy zero (mifandray amin'ny risika ara-portam-pahafinaretana), antsoina hoe MBR Classifiers (Sary 3F).
Amin'ity cohort fiofanana ity (icam246), score MBR (MBR <0, ambany MBR) dia nifandray tamin'ny risika ambany kokoa noho ny fahafatesana (85%). Ny mpikaroka dia nanamafy ny fikambanana teo amin'ny MBR (risika (risika) ary ny OS maharitra ao anaty cohorts (icam42 sy ny tcga-coad). .
Sary 3. Microbiome ao amin'ny fivontosana sy ny tavy sy ny fifandraisany sy ny fifandraisan'ny ICR sy ny fahaveloman'ny marary.
Famaranana
Ny fomba fiasa marobe amin'ny fandalinana dia ahafahana mamantatra tsara sy famakafakana ny sonia molekiola momba ny valin-kafatra ao amin'ny kansera colorectal ary manambara ny fifaneraserana eo amin'ny Microbiome sy ny rafitra fanefitra. Ny fanonganana ny fivontosana sy ny tsimok'aretina lalina dia nanambara fa ny vokatry ny ICR prognostika dia noho ny fahaizany misambotra ny fivontosana ny fivontosana ary mety ho fehezam-boninkazo antigen-manokana.
Amin'ny famakafakana ny fitrandrahana microbiome amin'ny alàlan'ny santionany 16s Rrna amin'ny santionany amin'ny 16s RRNA Na dia avy amin'ny santionany aza io sonia io, dia nisy ny fanitsiana mafy teo anelanelan'ny colorectum ara-pahasalamana sy ny tandindomin-doza MBR, nanolo-kevitra fa ny sonia dia mety hisambotra ny sonia microbiome ny marary. Amin'ny fampifangaroana ny isa ICR sy MBR, dia azo atao ny mamantatra sy manamarina ny mpianatra biomarista marobe izay manombatombana ny fahaveloman'ny marary amin'ny homamiadan'ny Colon. Ny Dataset Multi-OMIC dia manome loharanom-pahalalana bebe kokoa hahatakatra bebe kokoa ny biolojika Colon ary ampio ny fomba fiasa fitsaboana manokana.
Paositra: Jun-15-2023
Fiovana momba ny tsiambaratelo